Clara Almagro Vidal es doctora por la Universidad de Granada desde 2012 con la tesis “Frontera, medio ambiente y organización social del espacio: De la cuenca del Guadiana a Sierra Morena (Edad Media)”. Dicha tesis obtuvo calificación Cum Laude y ha sido Premio Extraordinario de Doctorado en el área de Humanidades.

Sus líneas de investigación principales abordan cuestiones de organización social del espacio, poblamiento y medio ambiente en la Edad Media, además del estudio del mudejarismo. Sobre estos temas ha publicado numerosos trabajos tanto en foros nacionales como internacionales de reconocido prestigio.

Asimismo, ha sido colaboradora en un proyecto de extracción y publicación de la información contenida la colección de Hidalguía del Archivo de la Real Chancillería de Granada, que ha dado como fruto la publicación varios volúmenes.